朱恒鹏自2014年起出任中国社会科学院经济研究所副所长，兼任中国社会科学院公共政策研究中心主任，同时亦为国家财政部等多部委医改咨询专家。

他具有丰富国企改革研究经验，曾领导团队进行10年医疗卫生体制改革追踪研究，调研全国21省市。

作为经济学教授，他的研究方向包括产业组织理论、卫生经济学及公共经济学等，近年主力研究公立医院改革、医疗服务模式创新、医疗保障制度及药品流通和定价体制等。

朱恒鹏于1991年获北京科技大学工学学士学位，1999年获中国社会科学院颁授经济学博士学位。